Le Japon se prépare pour les prochains Jeux Sportifs Mondiaux qui ont lieu à Tokyo. Il est annoncé que le tout nouveau train supraconducteur linéaire, le premier au monde à opérer dans un tunnel sous vide, sera ouvert au public. Construit avec la dernière technologie japonaise et capable d'atteindre 1000 km/h, son inauguration est programmée pour la cérémonie d'ouverture des JSM. Mais d'étranges incidents ont lieu, puis des célèbres chefs d'entreprise sont enlevés. Le détective Conan enquête et trouve un lien avec les kidnappings qui ont eu lieu aux JSM de Boston 15 ans auparavant...
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